Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NFX1Q12986 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFX1Q12986 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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