Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC173Q0VFZ6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC173Q0VFZ6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms