Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCBP1Q09161 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms