Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN1Q05586 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIN1Q05586 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms