Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF11Q05519 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF11Q05519 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms