Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBXN1Q04323 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN1Q04323 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms