Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE1BQ01064 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE1BQ01064 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms