Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM193AP78312 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms