Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOMO3P69849 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms