Protein–RNA interactions for Protein: P62424

RPL7A, 60S ribosomal protein L7a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL7AP62424 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL7AP62424 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms