Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTR3P61158 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms