Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms