Protein–RNA interactions for Protein: P56589

PEX3, Peroxisomal biogenesis factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX3P56589 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX3P56589 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX3P56589 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX3P56589 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX3P56589 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX3P56589 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX3P56589 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX3P56589 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX3P56589 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX3P56589 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX3P56589 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX3P56589 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX3P56589 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX3P56589 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX3P56589 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX3P56589 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX3P56589 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX3P56589 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX3P56589 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX3P56589 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX3P56589 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX3P56589 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX3P56589 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX3P56589 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX3P56589 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX3P56589 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX3P56589 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX3P56589 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX3P56589 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX3P56589 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX3P56589 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX3P56589 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX3P56589 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX3P56589 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX3P56589 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX3P56589 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX3P56589 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX3P56589 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX3P56589 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX3P56589 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX3P56589 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX3P56589 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX3P56589 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEX3P56589 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEX3P56589 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEX3P56589 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEX3P56589 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEX3P56589 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEX3P56589 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX3P56589 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX3P56589 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX3P56589 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX3P56589 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX3P56589 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX3P56589 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX3P56589 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX3P56589 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX3P56589 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX3P56589 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX3P56589 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX3P56589 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX3P56589 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX3P56589 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX3P56589 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX3P56589 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX3P56589 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX3P56589 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX3P56589 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX3P56589 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX3P56589 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX3P56589 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX3P56589 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX3P56589 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX3P56589 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX3P56589 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX3P56589 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX3P56589 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX3P56589 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX3P56589 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX3P56589 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX3P56589 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX3P56589 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX3P56589 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX3P56589 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX3P56589 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX3P56589 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX3P56589 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX3P56589 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX3P56589 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX3P56589 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX3P56589 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX3P56589 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX3P56589 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX3P56589 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX3P56589 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX3P56589 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX3P56589 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX3P56589 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX3P56589 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX3P56589 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms