Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPTEP56180 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPTEP56180 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPTEP56180 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPTEP56180 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPTEP56180 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPTEP56180 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPTEP56180 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TPTEP56180 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPTEP56180 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPTEP56180 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPTEP56180 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPTEP56180 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPTEP56180 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPTEP56180 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPTEP56180 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPTEP56180 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPTEP56180 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TPTEP56180 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPTEP56180 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPTEP56180 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPTEP56180 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPTEP56180 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPTEP56180 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TPTEP56180 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TPTEP56180 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TPTEP56180 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPTEP56180 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPTEP56180 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPTEP56180 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPTEP56180 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPTEP56180 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPTEP56180 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPTEP56180 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPTEP56180 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPTEP56180 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPTEP56180 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TPTEP56180 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPTEP56180 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPTEP56180 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPTEP56180 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms