Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLTPP55058 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLTPP55058 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLTPP55058 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLTPP55058 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLTPP55058 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLTPP55058 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLTPP55058 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PLTPP55058 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PLTPP55058 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PLTPP55058 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PLTPP55058 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLTPP55058 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLTPP55058 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLTPP55058 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLTPP55058 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLTPP55058 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLTPP55058 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLTPP55058 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLTPP55058 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLTPP55058 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLTPP55058 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLTPP55058 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLTPP55058 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLTPP55058 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLTPP55058 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLTPP55058 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLTPP55058 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLTPP55058 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLTPP55058 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLTPP55058 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLTPP55058 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLTPP55058 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PLTPP55058 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLTPP55058 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLTPP55058 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLTPP55058 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLTPP55058 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLTPP55058 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLTPP55058 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLTPP55058 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLTPP55058 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLTPP55058 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLTPP55058 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLTPP55058 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLTPP55058 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLTPP55058 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PLTPP55058 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLTPP55058 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLTPP55058 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLTPP55058 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PLTPP55058 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLTPP55058 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLTPP55058 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLTPP55058 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLTPP55058 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLTPP55058 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLTPP55058 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLTPP55058 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLTPP55058 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLTPP55058 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLTPP55058 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLTPP55058 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLTPP55058 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLTPP55058 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLTPP55058 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLTPP55058 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLTPP55058 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLTPP55058 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLTPP55058 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLTPP55058 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLTPP55058 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLTPP55058 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLTPP55058 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLTPP55058 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLTPP55058 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PLTPP55058 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLTPP55058 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLTPP55058 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLTPP55058 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms