Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNA2D1P54289 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D1P54289 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms