Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms