Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRYBA4P53673 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms