Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms