Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGDP52209 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGDP52209 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGDP52209 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGDP52209 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGDP52209 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGDP52209 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGDP52209 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGDP52209 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGDP52209 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGDP52209 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGDP52209 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGDP52209 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGDP52209 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGDP52209 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGDP52209 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGDP52209 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGDP52209 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGDP52209 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGDP52209 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGDP52209 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGDP52209 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGDP52209 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGDP52209 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGDP52209 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGDP52209 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGDP52209 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGDP52209 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGDP52209 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGDP52209 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGDP52209 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGDP52209 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGDP52209 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGDP52209 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGDP52209 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGDP52209 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGDP52209 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PGDP52209 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGDP52209 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGDP52209 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGDP52209 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms