Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPT1P50897 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPT1P50897 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPT1P50897 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPT1P50897 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPT1P50897 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPT1P50897 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPT1P50897 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPT1P50897 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPT1P50897 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPT1P50897 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPT1P50897 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPT1P50897 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPT1P50897 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPT1P50897 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPT1P50897 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPT1P50897 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPT1P50897 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPT1P50897 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPT1P50897 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPT1P50897 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPT1P50897 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPT1P50897 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPT1P50897 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPT1P50897 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPT1P50897 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPT1P50897 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPT1P50897 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPT1P50897 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPT1P50897 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPT1P50897 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPT1P50897 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PPT1P50897 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPT1P50897 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPT1P50897 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPT1P50897 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPT1P50897 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms