Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERFP50548 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERFP50548 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERFP50548 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERFP50548 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERFP50548 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERFP50548 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERFP50548 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERFP50548 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERFP50548 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERFP50548 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERFP50548 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERFP50548 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERFP50548 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERFP50548 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERFP50548 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERFP50548 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERFP50548 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERFP50548 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERFP50548 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERFP50548 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERFP50548 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERFP50548 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERFP50548 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERFP50548 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERFP50548 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERFP50548 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERFP50548 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERFP50548 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERFP50548 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERFP50548 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERFP50548 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERFP50548 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERFP50548 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERFP50548 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERFP50548 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERFP50548 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERFP50548 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERFP50548 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERFP50548 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERFP50548 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERFP50548 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERFP50548 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERFP50548 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERFP50548 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERFP50548 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERFP50548 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERFP50548 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERFP50548 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERFP50548 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERFP50548 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERFP50548 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERFP50548 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERFP50548 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERFP50548 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERFP50548 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERFP50548 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERFP50548 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERFP50548 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms