Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITPNBP48739 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITPNBP48739 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms