Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALDH1A3P47895 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms