Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGIRP43119 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGIRP43119 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms