Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA2P42262 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA2P42262 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms