Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX2P40425 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX2P40425 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX2P40425 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PBX2P40425 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX2P40425 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX2P40425 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX2P40425 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX2P40425 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX2P40425 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX2P40425 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX2P40425 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX2P40425 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX2P40425 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX2P40425 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX2P40425 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX2P40425 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX2P40425 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PBX2P40425 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX2P40425 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX2P40425 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX2P40425 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX2P40425 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX2P40425 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX2P40425 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX2P40425 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX2P40425 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX2P40425 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX2P40425 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX2P40425 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX2P40425 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX2P40425 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX2P40425 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX2P40425 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX2P40425 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX2P40425 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX2P40425 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PBX2P40425 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX2P40425 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX2P40425 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX2P40425 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX2P40425 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX2P40425 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX2P40425 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX2P40425 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX2P40425 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX2P40425 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX2P40425 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX2P40425 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX2P40425 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX2P40425 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX2P40425 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX2P40425 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX2P40425 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX2P40425 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PBX2P40425 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX2P40425 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX2P40425 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX2P40425 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX2P40425 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX2P40425 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX2P40425 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX2P40425 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX2P40425 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX2P40425 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX2P40425 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX2P40425 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX2P40425 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX2P40425 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PBX2P40425 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX2P40425 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX2P40425 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX2P40425 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX2P40425 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX2P40425 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX2P40425 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX2P40425 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX2P40425 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX2P40425 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX2P40425 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX2P40425 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX2P40425 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX2P40425 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX2P40425 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX2P40425 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX2P40425 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX2P40425 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX2P40425 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX2P40425 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PBX2P40425 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX2P40425 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX2P40425 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX2P40425 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX2P40425 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX2P40425 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX2P40425 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX2P40425 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX2P40425 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX2P40425 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX2P40425 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms