Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms