Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 32
GTF2F1P35269 LINC00963-216ENST00000623185 786 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 32
GTF2F1P35269 LINC00963-214ENST00000622680 781 ntTSL 1 (best)12.61□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 32
GTF2F1P35269 LINC00963-220ENST00000625171 830 ntTSL 512.41□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 32
GTF2F1P35269 LINC00963-207ENST00000454635 910 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 32
GTF2F1P35269 LINC00963-209ENST00000607931 473 ntTSL 59.59□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 32
GTF2F1P35269 LINC00963-219ENST00000624390 472 ntTSL 59.14□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 32
GTF2F1P35269 LINC00963-218ENST00000624138 261 ntTSL 58.58□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 32
GTF2F1P35269 LINC00963-215ENST00000622972 444 ntTSL 56.55□□□□□ -1.361e-6■■■■■ 32
GTF2F1P35269 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 32
GTF2F1P35269 PSAT1-202ENST00000376588 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 32
GTF2F1P35269 CERS2-206ENST00000421609 738 ntTSL 328.71■■■□□ 2.197e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 CARD10-204ENST00000433485 578 ntTSL 422.16■■□□□ 1.147e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 LRPAP1-203ENST00000509198 1170 ntTSL 221.89■■□□□ 1.097e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 LRPAP1-201ENST00000296325 1078 ntTSL 1 (best)20.8■□□□□ 0.927e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 CARD10-205ENST00000437756 2140 ntTSL 1 (best)19.92■□□□□ 0.787e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 PRRG1-206ENST00000484460 582 ntTSL 419.36■□□□□ 0.697e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.647e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 PRRG1-204ENST00000466533 628 ntTSL 319■□□□□ 0.637e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.597e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.567e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.567e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 LRPAP1-204ENST00000515119 1167 ntTSL 218.16■□□□□ 0.57e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.327e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 KIZ-205ENST00000611685 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.6■□□□□ 0.257e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.157e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.157e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MYL6-216ENST00000550184 1564 ntTSL 515.89■□□□□ 0.137e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MYL6-204ENST00000546630 544 ntTSL 1 (best)15.68■□□□□ 0.17e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.017e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -07e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.067e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.117e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.147e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 KIZ-212ENST00000620553 558 ntTSL 314.08□□□□□ -0.167e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MYL6-212ENST00000548725 582 ntTSL 214.05□□□□□ -0.167e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.27e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MYL6-208ENST00000547703 675 ntTSL 513.64□□□□□ -0.237e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 PRRG1-209ENST00000543642 4509 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.437e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 PRR7-AS1-201ENST00000425316 741 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.517e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 PRRG1-207ENST00000491253 650 ntTSL 311.69□□□□□ -0.547e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 AF241726.2-201ENST00000465127 954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.547e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 KIZ-210ENST00000619189 2130 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.577e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 PRRG1-208ENST00000542554 4600 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.617e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MCF2L-223ENST00000473345 399 ntTSL 311.24□□□□□ -0.617e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 PRRG1-201ENST00000378628 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.677e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MYL6-217ENST00000550639 419 ntTSL 510.48□□□□□ -0.737e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MYL6-206ENST00000547408 683 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.777e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MTSS1-218ENST00000529463 569 ntTSL 410.23□□□□□ -0.777e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MYL6-207ENST00000547649 655 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.787e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MCF2L-227ENST00000486806 361 ntTSL 310.08□□□□□ -0.87e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MYL6B-203ENST00000548571 223 ntTSL 49.76□□□□□ -0.857e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MYL6-214ENST00000549392 411 ntTSL 59.75□□□□□ -0.857e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MYL6-201ENST00000293422 664 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.037e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.147e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MYL6-221ENST00000552297 454 ntTSL 37.57□□□□□ -1.27e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 PRR7-AS1-202ENST00000506465 421 ntTSL 37.39□□□□□ -1.237e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.347e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 PRRG1-205ENST00000470290 760 ntTSL 1 (best)6.24□□□□□ -1.417e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.717e-9■■■■■ 32
GTF2F1P35269 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 32
GTF2F1P35269 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 32
GTF2F1P35269 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 32
GTF2F1P35269 CDC42-205ENST00000498236 816 ntTSL 58.17□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 32
GTF2F1P35269 AC134978.1-201ENST00000579480 788 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.584e-10■■■■■ 32
GTF2F1P35269 SLC6A6-205ENST00000613930 988 ntTSL 220.96■□□□□ 0.957e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 SLC6A6-211ENST00000622810 565 ntTSL 418.81■□□□□ 0.67e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.971e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.631e-9■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 AC118553.2-205ENST00000638779 1983 ntTSL 525.22■■□□□ 1.631e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 ENKD1-204ENST00000602531 888 ntTSL 324.56■■□□□ 1.521e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.075e-7■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.981e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 AC118553.2-204ENST00000639040 2568 ntTSL 521.11■□□□□ 0.971e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.961e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.921e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.841e-9■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 BCS1L-209ENST00000430322 1036 ntTSL 520.05■□□□□ 0.81e-9■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 BCS1L-214ENST00000456050 815 ntTSL 520.05■□□□□ 0.81e-9■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 AC118553.2-201ENST00000638968 3175 ntTSL 518.89■□□□□ 0.611e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.561e-9■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.561e-9■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 BCS1L-206ENST00000423377 583 ntTSL 318.27■□□□□ 0.521e-9■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.481e-9■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 SKA2-209ENST00000583976 570 ntTSL 217.85■□□□□ 0.451e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.53■□□□□ 0.41e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.361e-9■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.291e-9■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 BCS1L-208ENST00000428880 804 ntTSL 415.13■□□□□ 0.011e-9■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -01e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 AC118553.2-208ENST00000640357 3488 ntTSL 513.82□□□□□ -0.21e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 BCS1L-213ENST00000443791 580 ntTSL 313.37□□□□□ -0.271e-9■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 AC118553.2-206ENST00000639171 5352 ntTSL 512.92□□□□□ -0.341e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 C7orf71-202ENST00000614528 1963 ntTSL 1 (best)12.51□□□□□ -0.411e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 SKA2-204ENST00000578519 894 ntTSL 312.26□□□□□ -0.451e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 SKA2-207ENST00000583380 583 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.521e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 SKA2-206ENST00000581068 595 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 31.9
GTF2F1P35269 BCS1L-219ENST00000490188 647 ntTSL 311.45□□□□□ -0.581e-9■■■■■ 31.9
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 127.5 ms