Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA1P35221 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms