Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms