Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB2P29033 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB2P29033 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB2P29033 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB2P29033 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB2P29033 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB2P29033 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB2P29033 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB2P29033 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB2P29033 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB2P29033 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB2P29033 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB2P29033 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB2P29033 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB2P29033 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB2P29033 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB2P29033 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB2P29033 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB2P29033 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB2P29033 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB2P29033 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB2P29033 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB2P29033 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB2P29033 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB2P29033 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB2P29033 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB2P29033 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB2P29033 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB2P29033 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB2P29033 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB2P29033 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB2P29033 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB2P29033 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB2P29033 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB2P29033 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB2P29033 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB2P29033 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB2P29033 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB2P29033 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB2P29033 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB2P29033 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB2P29033 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB2P29033 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB2P29033 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB2P29033 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB2P29033 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB2P29033 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB2P29033 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB2P29033 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB2P29033 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB2P29033 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB2P29033 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB2P29033 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB2P29033 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB2P29033 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB2P29033 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB2P29033 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB2P29033 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB2P29033 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB2P29033 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB2P29033 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB2P29033 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB2P29033 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB2P29033 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB2P29033 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB2P29033 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB2P29033 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB2P29033 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB2P29033 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB2P29033 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB2P29033 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB2P29033 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB2P29033 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB2P29033 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB2P29033 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB2P29033 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJB2P29033 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJB2P29033 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJB2P29033 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJB2P29033 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJB2P29033 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJB2P29033 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB2P29033 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB2P29033 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB2P29033 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB2P29033 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB2P29033 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB2P29033 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB2P29033 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB2P29033 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB2P29033 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB2P29033 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB2P29033 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB2P29033 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB2P29033 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB2P29033 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB2P29033 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB2P29033 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB2P29033 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB2P29033 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms