Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFRSF8P28908 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF8P28908 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms