Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSFA2P28290 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSFA2P28290 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms