Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KDELR1P24390 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms