Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLA-DPA1P20036 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms