Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCFC2P16383 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCFC2P16383 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms