Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.44
LAMC1P11047 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
LAMC1P11047 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LAMC1P11047 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms