Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00032P0C843 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00032P0C843 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms