Protein–RNA interactions for Protein: P09923

ALPI, Intestinal-type alkaline phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPIP09923 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPIP09923 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPIP09923 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALPIP09923 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPIP09923 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPIP09923 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPIP09923 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPIP09923 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPIP09923 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPIP09923 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPIP09923 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPIP09923 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPIP09923 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPIP09923 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPIP09923 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPIP09923 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALPIP09923 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPIP09923 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPIP09923 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPIP09923 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPIP09923 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPIP09923 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPIP09923 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPIP09923 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPIP09923 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPIP09923 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPIP09923 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPIP09923 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALPIP09923 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ALPIP09923 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALPIP09923 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPIP09923 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPIP09923 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPIP09923 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPIP09923 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPIP09923 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPIP09923 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPIP09923 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPIP09923 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPIP09923 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPIP09923 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ALPIP09923 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPIP09923 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPIP09923 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPIP09923 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPIP09923 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALPIP09923 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALPIP09923 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALPIP09923 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALPIP09923 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALPIP09923 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALPIP09923 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALPIP09923 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ALPIP09923 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ALPIP09923 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ALPIP09923 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALPIP09923 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALPIP09923 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPIP09923 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALPIP09923 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALPIP09923 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPIP09923 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALPIP09923 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPIP09923 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPIP09923 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPIP09923 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALPIP09923 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPIP09923 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALPIP09923 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALPIP09923 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALPIP09923 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALPIP09923 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALPIP09923 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALPIP09923 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALPIP09923 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALPIP09923 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALPIP09923 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALPIP09923 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms