Protein–RNA interactions for Protein: P01588

EPO, Erythropoietin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOP01588 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPOP01588 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPOP01588 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPOP01588 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPOP01588 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPOP01588 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPOP01588 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPOP01588 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPOP01588 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPOP01588 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPOP01588 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPOP01588 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPOP01588 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPOP01588 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPOP01588 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EPOP01588 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPOP01588 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPOP01588 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPOP01588 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPOP01588 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPOP01588 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPOP01588 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPOP01588 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPOP01588 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
EPOP01588 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EPOP01588 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPOP01588 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPOP01588 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EPOP01588 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPOP01588 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPOP01588 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPOP01588 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPOP01588 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPOP01588 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPOP01588 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPOP01588 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
EPOP01588 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EPOP01588 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPOP01588 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPOP01588 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EPOP01588 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPOP01588 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPOP01588 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EPOP01588 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPOP01588 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPOP01588 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EPOP01588 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPOP01588 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPOP01588 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
EPOP01588 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPOP01588 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPOP01588 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EPOP01588 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EPOP01588 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EPOP01588 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EPOP01588 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPOP01588 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPOP01588 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EPOP01588 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPOP01588 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPOP01588 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EPOP01588 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EPOP01588 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPOP01588 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPOP01588 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EPOP01588 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPOP01588 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPOP01588 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EPOP01588 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EPOP01588 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EPOP01588 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPOP01588 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EPOP01588 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPOP01588 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPOP01588 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPOP01588 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EPOP01588 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EPOP01588 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPOP01588 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPOP01588 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPOP01588 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EPOP01588 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPOP01588 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPOP01588 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPOP01588 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPOP01588 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPOP01588 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EPOP01588 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPOP01588 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EPOP01588 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EPOP01588 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPOP01588 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPOP01588 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EPOP01588 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPOP01588 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPOP01588 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EPOP01588 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
EPOP01588 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPOP01588 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPOP01588 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms