Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM2O94769 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM2O94769 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM2O94769 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM2O94769 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM2O94769 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM2O94769 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM2O94769 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM2O94769 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM2O94769 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM2O94769 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM2O94769 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM2O94769 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM2O94769 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM2O94769 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM2O94769 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM2O94769 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM2O94769 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM2O94769 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM2O94769 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM2O94769 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM2O94769 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM2O94769 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM2O94769 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM2O94769 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM2O94769 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM2O94769 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM2O94769 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM2O94769 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM2O94769 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM2O94769 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM2O94769 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM2O94769 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM2O94769 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM2O94769 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM2O94769 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM2O94769 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM2O94769 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM2O94769 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM2O94769 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM2O94769 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM2O94769 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ECM2O94769 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ECM2O94769 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ECM2O94769 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ECM2O94769 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM2O94769 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM2O94769 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM2O94769 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM2O94769 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM2O94769 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM2O94769 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM2O94769 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM2O94769 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM2O94769 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM2O94769 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM2O94769 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM2O94769 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM2O94769 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM2O94769 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM2O94769 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM2O94769 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM2O94769 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM2O94769 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM2O94769 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM2O94769 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM2O94769 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM2O94769 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM2O94769 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM2O94769 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM2O94769 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM2O94769 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM2O94769 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM2O94769 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms