Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK2O60296 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAK2O60296 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms