Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DENRO43583 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DENRO43583 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DENRO43583 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DENRO43583 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DENRO43583 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DENRO43583 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DENRO43583 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DENRO43583 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DENRO43583 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DENRO43583 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DENRO43583 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DENRO43583 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DENRO43583 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DENRO43583 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DENRO43583 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
DENRO43583 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
DENRO43583 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DENRO43583 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DENRO43583 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DENRO43583 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DENRO43583 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DENRO43583 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
DENRO43583 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DENRO43583 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DENRO43583 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
DENRO43583 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DENRO43583 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DENRO43583 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DENRO43583 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DENRO43583 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DENRO43583 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DENRO43583 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DENRO43583 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DENRO43583 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DENRO43583 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DENRO43583 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DENRO43583 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DENRO43583 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DENRO43583 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DENRO43583 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DENRO43583 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DENRO43583 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DENRO43583 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DENRO43583 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DENRO43583 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DENRO43583 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DENRO43583 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DENRO43583 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DENRO43583 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DENRO43583 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DENRO43583 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DENRO43583 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DENRO43583 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DENRO43583 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DENRO43583 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DENRO43583 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DENRO43583 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DENRO43583 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DENRO43583 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DENRO43583 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DENRO43583 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DENRO43583 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DENRO43583 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DENRO43583 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DENRO43583 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DENRO43583 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DENRO43583 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DENRO43583 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DENRO43583 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DENRO43583 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DENRO43583 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DENRO43583 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DENRO43583 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DENRO43583 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DENRO43583 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DENRO43583 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DENRO43583 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DENRO43583 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DENRO43583 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DENRO43583 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DENRO43583 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DENRO43583 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DENRO43583 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DENRO43583 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DENRO43583 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DENRO43583 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DENRO43583 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DENRO43583 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DENRO43583 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DENRO43583 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DENRO43583 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DENRO43583 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms