Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SART1O43290 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SART1O43290 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SART1O43290 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SART1O43290 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SART1O43290 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SART1O43290 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SART1O43290 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SART1O43290 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SART1O43290 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SART1O43290 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SART1O43290 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SART1O43290 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SART1O43290 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SART1O43290 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SART1O43290 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SART1O43290 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SART1O43290 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SART1O43290 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SART1O43290 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SART1O43290 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SART1O43290 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SART1O43290 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SART1O43290 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SART1O43290 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SART1O43290 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SART1O43290 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SART1O43290 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SART1O43290 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SART1O43290 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SART1O43290 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SART1O43290 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SART1O43290 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SART1O43290 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SART1O43290 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SART1O43290 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SART1O43290 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SART1O43290 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SART1O43290 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SART1O43290 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SART1O43290 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SART1O43290 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SART1O43290 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SART1O43290 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SART1O43290 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SART1O43290 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SART1O43290 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SART1O43290 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SART1O43290 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SART1O43290 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SART1O43290 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SART1O43290 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SART1O43290 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SART1O43290 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SART1O43290 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SART1O43290 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SART1O43290 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SART1O43290 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SART1O43290 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SART1O43290 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SART1O43290 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SART1O43290 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SART1O43290 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SART1O43290 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SART1O43290 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SART1O43290 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SART1O43290 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SART1O43290 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SART1O43290 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SART1O43290 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SART1O43290 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SART1O43290 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SART1O43290 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SART1O43290 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SART1O43290 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SART1O43290 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SART1O43290 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SART1O43290 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SART1O43290 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SART1O43290 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms