Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BCKDKO14874 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BCKDKO14874 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BCKDKO14874 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BCKDKO14874 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BCKDKO14874 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BCKDKO14874 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BCKDKO14874 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BCKDKO14874 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BCKDKO14874 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BCKDKO14874 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms