Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DFFAO00273 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DFFAO00273 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DFFAO00273 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DFFAO00273 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DFFAO00273 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DFFAO00273 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DFFAO00273 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DFFAO00273 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DFFAO00273 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DFFAO00273 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DFFAO00273 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DFFAO00273 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DFFAO00273 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DFFAO00273 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DFFAO00273 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DFFAO00273 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DFFAO00273 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DFFAO00273 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DFFAO00273 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DFFAO00273 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DFFAO00273 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DFFAO00273 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DFFAO00273 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DFFAO00273 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DFFAO00273 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DFFAO00273 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DFFAO00273 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DFFAO00273 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DFFAO00273 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DFFAO00273 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DFFAO00273 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DFFAO00273 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DFFAO00273 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DFFAO00273 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DFFAO00273 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DFFAO00273 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DFFAO00273 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DFFAO00273 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DFFAO00273 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DFFAO00273 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DFFAO00273 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DFFAO00273 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DFFAO00273 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DFFAO00273 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DFFAO00273 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DFFAO00273 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DFFAO00273 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DFFAO00273 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DFFAO00273 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DFFAO00273 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DFFAO00273 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DFFAO00273 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DFFAO00273 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DFFAO00273 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DFFAO00273 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DFFAO00273 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DFFAO00273 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DFFAO00273 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DFFAO00273 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DFFAO00273 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DFFAO00273 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DFFAO00273 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DFFAO00273 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DFFAO00273 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DFFAO00273 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DFFAO00273 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DFFAO00273 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DFFAO00273 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DFFAO00273 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DFFAO00273 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DFFAO00273 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DFFAO00273 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DFFAO00273 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DFFAO00273 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DFFAO00273 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DFFAO00273 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DFFAO00273 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DFFAO00273 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DFFAO00273 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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