Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX39AO00148 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX39AO00148 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX39AO00148 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX39AO00148 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX39AO00148 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX39AO00148 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX39AO00148 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX39AO00148 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX39AO00148 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX39AO00148 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX39AO00148 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX39AO00148 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX39AO00148 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX39AO00148 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX39AO00148 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX39AO00148 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX39AO00148 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX39AO00148 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms