Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms