Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRDCB7Z8K6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms